RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRF1Q5T601 910 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF34Q969K3 372 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTLC3Q9NUV7 552 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAN2B1O00754 1011 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTA1Q13330 715 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTN2A3PQ96KV6 586 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO1AQ9UBC5 1043 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSL4O60488 711 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENDOD1O94919 500 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADH5P11766 374 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDXP35241 583 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALCP54803 685 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP11AP98196 1134 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM25Q86YD3 366 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC170Q8IYT3 715 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNU1A8MYU2 1149 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCR3P49682 368 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAD2Q05329 585 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRMS1LQ5PSV4 323 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF852Q6ZMS4 543 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPGS1Q6ZTW0 290 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRADAQ7RTN6 431 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMTC1Q8IUR5 882 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARK1Q9P0L2 795 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRE11P49959 708 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDO1Q16878 200 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHFRQ96EP1 664 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFSD1Q9H3U5 465 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDCPQ9H6R7 721 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHISA7A6NL88 538 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 VCPP55072 806 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANO4Q32M45 955 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM3CQ92520 227 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNPY3Q9BT09 278 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D17Q9HA65 648 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM191CA6NGB0 347 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP1A2P05177 515 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2AFZP0C0S5 128 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 DESP17661 470 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSDMDP57764 484 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAB4Q2WGN9 574 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNDC11Q6PKC3 985 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2AFVQ71UI9 128 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNIP1Q8TF40 1166 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM172AQ8WUF8 416 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 BBS2Q9BXC9 721 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 KANSL1LA0AUZ9 987 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD72P21854 359 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 PACSIN1Q9BY11 444 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYBBP04839 570 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 OGDHQ02218 1023 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf76Q5T2E6 689 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 NADSYN1Q6IA69 706 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOC4Q96A65 974 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TKTL2Q9H0I9 626 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFRA2O00451 464 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCP110O43303 1012 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCA5LO95447 670 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM253P0C7T8 217 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM131BQ86XD5 332 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF26Q96DR7 871 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 NELL2Q99435 816 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOWAHDA6NJG2 315 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK25O00506 426 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYRP14679 529 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC6A4P31645 630 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDAC4P56524 1084 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPPE1Q53F39 396 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLCNQ8NFG4 579 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PBXIP1Q96AQ6 731 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP85Q9BW27 656 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LTB4R2Q9NPC1 389 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf16Q9NQ32 467 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR37L1O60883 481 aa34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms