RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	WASH3P	C4AMC7	463 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200		E5RJQ4	531 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAM1	P13591	858 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNMA1	Q12791	1236 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCL	Q13371	301 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM215	Q68D42	235 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SDE2	Q6IQ49	451 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS45	Q9NRW7	570 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		22.67	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN3	O60637	253 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCN1	P35523	988 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	USP8	P40818	1118 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX4	P57082	545 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NNT	Q13423	1086 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CKAP5	Q14008	2032 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A13	Q96H72	371 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RTKN	Q9BST9	563 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD54B	Q9Y620	910 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		22.66	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ18	B7U540	433 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC30A4	O14863	429 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NPC1	O15118	1278 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-F	P30511	346 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A4	P31645	630 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SGSH	P51688	502 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CREB5	Q02930	508 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ12	Q14500	433 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PGBD3	Q8N328	593 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SPACA7	Q96KW9	195 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB11	Q96P15	392 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GBP4	Q96PP9	640 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX5	Q9H2C1	402 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSL4	O60488	711 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV3-25	P01717	112 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFV2	P19404	249 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IL12RB1	P42701	662 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMK1	P53667	647 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP7	Q5T2T1	576 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TAC4	Q86UU9	113 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CPXM1	Q96SM3	734 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		22.65	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PI4KA	P42356	2102 aa		22.64	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CAVIN2	O95810	425 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC11A2	P49281	568 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	PTK2	Q05397	1052 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM32	Q8TC27	787 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	UCMA	Q8WVF2	138 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		22.64	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	IRAK2	O43187	625 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM44	O43615	452 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF234	Q14588	700 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF5	Q15542	800 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		22.63	■■□□□ 1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		22.63	■■□□□ 1.21

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