RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	SRGAP2	O75044	1071 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	OLFM2	O95897	454 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	IGLV3-27	P01718	113 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KRT1	P04264	644 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CKM	P06732	381 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	HMBS	P08397	361 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	FSHR	P23945	695 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KDELR1	P24390	212 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	L1CAM	P32004	1257 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CXCR5	P32302	372 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	COPS2	P61201	443 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	AMPD2	Q01433	879 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SCAP	Q12770	1279 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	KRT81	Q14533	505 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	EFHC2	Q5JST6	749 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	PLD4	Q96BZ4	506 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	C1orf74	Q96LT6	269 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DCLK3	Q9C098	648 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	S1PR5	Q9H228	398 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.15	□□□□□ -0.78
KLC1-223	ENST00000557172	NCOR1	O75376	2440 aa		10.15	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		10.15	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	PAGE1	O75459	146 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	WEE1	P30291	646 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	LTBR	P36941	435 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	AVPR1A	P37288	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	HCAR3	P49019	387 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	SLC11A2	P49281	568 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ARSE	P51690	589 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	KCNQ1	P51787	676 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	CDH6	P55285	790 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	CLUL1	Q15846	466 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	DPYSL2	Q16555	572 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	CA9	Q16790	459 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ITFG1	Q8TB96	612 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	FAM71B	Q8TC56	605 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	STIM2	Q9P246	746 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	VCAN	P13611	3396 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172		H3BRJ5	948 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF185	O15231	689 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	ACSL4	O60488	711 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	STC2	O76061	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
KLC1-223	ENST00000557172	CEBPB	P17676	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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