RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CBLN3-202ENST00000555436 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.27■□□□□ 0.84
CBLN3-202ENST00000555436 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CBLN3-202ENST00000555436 DACH1Q9UI36 760 aa20.27■□□□□ 0.84
CBLN3-202ENST00000555436 RAD54BQ9Y620 910 aa20.27■□□□□ 0.84
CBLN3-202ENST00000555436 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.27■□□□□ 0.84
CBLN3-202ENST00000555436 WASH3PC4AMC7 463 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TSPAN3O60637 253 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 NCAM1P13591 858 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 NDUFV2P19404 249 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SLC11A2P49281 568 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TBX4P57082 545 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ENPP2Q13822 863 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 E2F5Q15329 346 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 MAN2A1Q16706 1144 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 BEND5Q7L4P6 421 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM110Q86TL2 294 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.26■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TIMM44O43615 452 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF217O75362 1048 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 USP8P40818 1118 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 NNTQ13423 1086 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 STARD3Q14849 445 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 STPG1Q5TH74 334 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 IL31Q6EBC2 164 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 AZIN2Q96A70 460 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SERPINB11Q96P15 392 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SIX2Q9NPC8 291 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SPTBN2O15020 2390 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.25■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 E5RJQ4 531 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 IRAK2O43187 625 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 HLA-FP30511 346 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 IL12RB1P42701 662 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PTGER3P43115 390 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PDCLQ13371 301 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 MPP7Q5T2T1 576 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM215Q68D42 235 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 RNF43Q68DV7 783 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PIGKQ92643 395 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 CIPCQ9C0C6 399 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 NDST4Q9H3R1 872 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.24■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 AP5Z1O43299 807 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ACSL4O60488 711 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF234Q14588 700 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 FUT11Q495W5 492 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 VWA3BQ502W6 1294 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 MIIPQ5JXC2 388 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SYT12Q8IV01 421 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SLC39A13Q96H72 371 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 EDEM2Q9BV94 578 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.23■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 LNP1A1A4G5 178 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 CAPN9O14815 690 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TM4SF5O14894 197 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SLC6A4P31645 630 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 DPP6P42658 865 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SGSHP51688 502 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 PTK2Q05397 1052 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 TAC4Q86UU9 113 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.22■□□□□ 0.83
CBLN3-202ENST00000555436 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.22■□□□□ 0.83
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