RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	NCDN	Q9UBB6	729 aa		21.73	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DGKE	P52429	567 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	JAM2	P57087	298 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	BPIFB4	P59827	614 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NNT	Q13423	1086 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	EOGT	Q5NDL2	527 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	RNF43	Q68DV7	783 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CEP68	Q76N32	757 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	KBTBD6	Q86V97	674 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DDI1	Q8WTU0	396 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SERPINB11	Q96P15	392 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		21.72	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PQF6	199 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	IRAK2	O43187	625 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	ACSL4	O60488	711 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	GRAP2	O75791	330 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CYBB	P04839	570 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	MPPE1	Q53F39	396 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	TMEM215	Q68D42	235 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	RAB23	Q9ULC3	237 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	INVS	Q9Y283	1065 aa		21.71	■■□□□ 1.07
CS-222	ENST00000550996	CAPN9	O14815	690 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	GFPT2	O94808	682 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TPM2	P07951	284 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	MME	P08473	750 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NTSR1	P30989	418 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DEFB106A	Q8N104	65 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	AZIN2	Q96A70	460 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NOX5	Q96PH1	765 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	EML5	Q05BV3	1969 aa		21.7	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	WASH3P	C4AMC7	463 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	GLI1	P08151	1106 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CHRNB2	P17787	502 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	HLA-F	P30511	346 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SLC11A2	P49281	568 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	UBXN1	Q04323	297 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	DCAF6	Q58WW2	860 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	GABRG3	Q99928	467 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		21.69	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	HSF2BP	O75031	334 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	RET	P07949	1114 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	HOXB2	P14652	356 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SOX5	P35711	763 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ZNF445	P59923	1031 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SLC6A3	Q01959	620 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	PLK5	Q496M5	336 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	C2CD6	Q53TS8	623 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	CHPF	Q8IZ52	775 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	HMGB4	Q8WW32	186 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		21.68	■■□□□ 1.06
CS-222	ENST00000550996	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		21.68	■■□□□ 1.06

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