RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN9P43378 593 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TUBP50607 506 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ART3Q13508 389 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 AMHR2Q16671 573 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 JAMLQ86YT9 394 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 COPS5Q92905 334 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD8Q96I13 439 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 VEGFDO43915 354 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FAM107AO95990 144 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FGGP02679 453 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 BDNFP23560 247 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MORF4L2Q15014 288 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 BBS4Q96RK4 519 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TLR5O60602 858 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PLTPP55058 493 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KBTBD6Q86V97 674 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PSMB7Q99436 277 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PSMD10O75832 226 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 IFNA14P01570 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 IDSP22304 550 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FLT3P36888 993 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A3Q01959 620 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM192Q8IY95 271 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 PHF24Q9UPV7 400 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ACRP10323 421 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GHRHRQ02643 423 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RGS1Q08116 209 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 SLC18A3Q16572 532 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-CQ95604 372 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GLP2RO95838 553 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 GLRA2P23416 452 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 DGKGP49619 791 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HIF1AQ16665 826 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 USP33Q8TEY7 942 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL18Q96ME1 805 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CDH19Q9H159 772 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 TASP1Q9H6P5 420 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SCNN1BP51168 640 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GPS1Q13098 491 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GRB10Q13322 594 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 MYLPFQ96A32 169 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ABCB6Q9NP58 842 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PP2D1A8MPX8 630 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SLITRK3O94933 977 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RBP3P10745 1247 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms