RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548489.6

TGIF1-211, Transcript of TGFB induced factor homeobox 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TGIF1, Length 1,536 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1-211ENST00000548489 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 CD52P31358 61 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 KCNC1P48547 511 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 ACOT2P49753 483 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 UBASH3AP57075 661 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 KRT31Q15323 416 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 MAN2A1Q16706 1144 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 KYAT1Q16773 422 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 TM4SF20Q53R12 229 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 FIGNQ5HY92 759 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 USP37Q86T82 979 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 DTX3Q8N9I9 347 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 BORCS6Q96GS4 357 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 TMEM209Q96SK2 561 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 TRIM5Q9C035 493 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 IFNKQ9P0W0 207 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 TBX21Q9UL17 535 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 PADI3Q9ULW8 664 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 CITO14578 2027 aa7.15□□□□□ -1.26
TGIF1-211ENST00000548489 SCN5AQ14524 2016 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 LGALS16A8MUM7 142 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 FAM189A1O60320 539 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ADRB2P07550 413 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CLTAP09496 248 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ZNF28P17035 718 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 RGS19P49795 217 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 VAMP7P51809 220 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CYP24A1Q07973 514 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 BFSP1Q12934 665 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 VPS16Q9H269 839 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CHST12Q9NRB3 414 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ANK1P16157 1881 aa7.15□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.272e-7■■■□□ 18.9
TGIF1-211ENST00000548489 KIAA0355O15063 1070 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 AP5Z1O43299 807 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 NOBOXO60393 691 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 STX10O60499 249 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 NBNO60934 754 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 IL18RAPO95256 599 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ADCY5O95622 1261 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ASMTLO95671 621 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 STAG3L1P0CL83 205 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CYP2C18P33260 490 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 TNFSF9P41273 254 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ZNF75DP51815 510 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CCL23P55773 120 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 OSTNP61366 133 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ENPEPQ07075 957 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 PSMD6Q15008 389 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 SURF1Q15526 300 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CRY1Q16526 586 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 UBXN11Q5T124 520 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 VASNQ6EMK4 673 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 HACE1Q8IYU2 909 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 SEPT8Q92599 483 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TGIF1-211ENST00000548489 ACAP3Q96P50 834 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms