RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMG2Q969U7 264 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 FAF2Q96CS3 445 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 GOT1P17174 413 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 NPNTQ6UXI9 565 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF34Q969K3 372 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC39A13Q96H72 371 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TLR5O60602 858 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 C8AP07357 584 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 EPCAMP16422 314 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SEMA3BQ13214 749 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TRADDQ15628 312 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 C8orf74Q6P047 294 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC3Q9BY71 257 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 IL21Q9HBE4 155 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TTI1O43156 1089 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 F11P03951 625 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 AMPD1P23109 780 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CHRNA3P32297 505 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 GGCXP38435 758 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNC3Q14003 757 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 VEPH1Q14D04 833 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCNG2Q16589 344 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 EFHC2Q5JST6 749 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MIB1Q86YT6 1006 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF670Q9BS34 389 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 AIF1P55008 147 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAM15Q13444 863 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TAF12Q16514 161 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 VSIG1Q86XK7 387 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF276Q8N554 614 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PLD5Q8N7P1 536 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINB11Q96P15 392 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF38Q9H0F5 515 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf78A6NCI8 922 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCR1P32246 355 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CLDND1Q9NY35 253 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF487B1APH4 448 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 LIASO43766 372 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CREB3O43889 395 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PAGE1O75459 146 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TBX4P57082 545 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP2R5DQ14738 602 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ACTL9Q8TC94 416 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC12A8A0AV02 714 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 COCHO43405 550 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 RFPL2O75678 378 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HMBSP08397 361 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 VSNL1P62760 191 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HECTD3Q5T447 861 aa22.71■■□□□ 1.23
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