RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	AP1G2	O75843	785 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	DNTT	P04053	509 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	ACP1	P24666	158 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	CHKA	P35790	457 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	ZBTB16	Q05516	673 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	SURF1	Q15526	300 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	SMO	Q99835	787 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM245	Q9H330	911 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276		K7ENP7	123 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	TIMM44	O43615	452 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	CD38	P28907	300 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	GABRE	P78334	506 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	E2F1	Q01094	437 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	GRIN1	Q05586	938 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PR77	199 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	WNT9A	O14904	365 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CYP26A1	O43174	497 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	RARG	P13631	454 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	RXRG	P48443	463 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PQH9	124 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	USP12	O75317	370 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CYBB	P04839	570 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	GAP43	P17677	238 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	LSS	P48449	732 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	GALC	P54803	685 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	HMBS	P08397	361 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC130	P13994	396 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	TNNI1	P19237	187 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	NXPH1	P58417	271 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	MYL6	P60660	151 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ALCAM	Q13740	583 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	GANC	Q8TET4	914 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM53C-208	ENST00000511276	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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