RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GFRA2O00451 464 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DCLK1O15075 740 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TRIM24O15164 1050 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ACSL4O60488 711 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 HSF2BPO75031 334 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 NDUFS2O75306 463 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF217O75362 1048 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EPN2O95208 641 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MOCS3O95396 460 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ABCB4P21439 1286 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MPLP40238 635 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DPP6P42658 865 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ST8SIA6P61647 398 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FOXK2Q01167 660 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 APBA1Q02410 837 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RING1Q06587 406 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MESP2Q0VG99 397 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CSRP2Q16527 193 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PLK5Q496M5 336 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DCAF6Q58WW2 860 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CHSY1Q86X52 802 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MFN1Q8IWA4 741 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 AHI1Q8N157 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GPT2Q8TD30 523 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 NETO1Q8TDF5 533 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 VPS45Q9NRW7 570 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 STIM2Q9P246 746 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PRRT4C9JH25 899 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 F5H5T6 163 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 H0Y626 953 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 AP5Z1O43299 807 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ADAM23O75077 832 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CAVIN2O95810 425 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 EPHX1P07099 455 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GLI1P08151 1106 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 UCHL3P15374 230 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CCR1P32246 355 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TPM4P67936 248 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 MTA1Q13330 715 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 NNTQ13423 1086 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KRT31Q15323 416 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CCDC6Q16204 474 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TAF3Q5VWG9 929 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 BEND5Q7L4P6 421 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM110Q86TL2 294 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 TAC4Q86UU9 113 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RASSF3Q86WH2 238 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ERICH1Q86X53 443 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 NEK11Q8NG66 645 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 RLN3Q8WXF3 142 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 STK33Q9BYT3 514 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 LHX5Q9H2C1 402 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ACP6Q9NPH0 428 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FANCLQ9NW38 375 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 DDIT4Q9NX09 232 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 GGA2Q9UJY4 613 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC6-232ENST00000489053 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms