RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 LRCH4O75427 683 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 GJB6O95452 261 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CTNNA2P26232 953 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 AVPR1AP37288 418 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 OGDHQ02218 1023 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ZNF569Q5MCW4 686 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 TRNP1Q6NT89 227 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 NT5DC3Q86UY8 548 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 VSIG1Q86XK7 387 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 FLCNQ8NFG4 579 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 E2F7Q96AV8 911 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 TRIM7Q9C029 511 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 WDCPQ9H6R7 721 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 OBP2AQ9NY56 170 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 USP18Q9UMW8 372 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 FAM170AA1A519 330 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 MDM4O15151 490 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 MOSPD3O75425 235 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 IGLV3-27P01718 113 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 APOEP02649 317 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 COMTP21964 271 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 HTR7P34969 479 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CETN2P41208 172 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 HARS2P49590 506 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 PGFP49763 221 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 HDAC4P56524 1084 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 TBX4P57082 545 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 GNG11P61952 73 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ATP11AP98196 1134 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 SCAPQ12770 1279 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 EFEMP1Q12805 493 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ERMARDQ5T6L9 678 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 GPR158Q5T848 1215 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 TAC4Q86UU9 113 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 MAP7D3Q8IWC1 876 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CMTM8Q8IZV2 173 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 CD101Q93033 1021 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 RNF34Q969K3 372 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 SLC39A13Q96H72 371 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 BTN2A3PQ96KV6 586 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 C1orf74Q96LT6 269 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 HAPLN3Q96S86 360 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 TRPV4Q9HBA0 871 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 RASAL2Q9UJF2 1139 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-211ENST00000488243 SLC12A8A0AV02 714 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 C2orf78A6NCI8 922 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZNF487B1APH4 448 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CKMP06732 381 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PRLRP16471 622 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MIPP30301 263 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ADRA1BP35368 520 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CCR2P41597 374 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 COPS2P61201 443 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CYP4F8P98187 520 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NME3Q13232 169 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PDK2Q15119 407 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RPS6KA1Q15418 735 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TEAD2Q15562 447 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CDO1Q16878 200 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TXNDC8Q6A555 127 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MAB21L3Q8N8X9 362 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RMDN1Q96DB5 314 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 HES6Q96HZ4 224 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 BTBD6Q96KE9 485 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLC46A2Q9BY10 475 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TRPC7Q9HCX4 862 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PIGVQ9NUD9 493 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TDP1Q9NUW8 608 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms