RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 TIMP1P01033 207 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 PBX3P40426 434 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MFN1Q8IWA4 741 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 RAD9AQ99638 391 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ASB3Q9Y575 518 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PQH9 124 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MAGEA4P43358 317 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 INCA1Q0VD86 236 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 TEKT4Q8WW24 435 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf72Q96LT7 481 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 RILPQ96NA2 401 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 GMIPQ9P107 970 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 KAT6AQ92794 2004 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CLUHO75153 1309 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINF2P08697 491 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 TAC1P20366 129 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 WEE1P30291 646 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 GPM6BQ13491 265 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MORF4L2Q15014 288 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD5Q6N075 450 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 PPM1EQ8WY54 764 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CABS1Q96KC9 395 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 NT5MQ9NPB1 228 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 PKP3Q9Y446 797 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNB2P17787 502 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NR1D1P20393 614 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GPD2P43304 727 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PTPN9P43378 593 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FAXCQ5TGI0 409 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 RPAINQ86UA6 219 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TNS4Q8IZW8 715 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 HES6Q96HZ4 224 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 RNF157Q96PX1 679 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SENP1Q9P0U3 644 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 C8AP07357 584 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 GALTP07902 379 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FLT3P36888 993 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 DAOAP59103 153 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 DENND1CQ8IV53 801 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PTPRN2Q92932 1015 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 BADQ92934 168 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 VPS11Q9H270 941 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FAM50BQ9Y247 325 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf81A6NN90 581 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 C9IYK1 514 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CDH16O75309 829 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TYK2P29597 1187 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 ADRA1BP35368 520 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 KRT33BQ14525 404 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 UPP1Q16831 310 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 TTC23LQ6PF05 361 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 MCUQ8NE86 351 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 FBF1Q8TES7 1133 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CERS4Q9HA82 394 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-211ENST00000486161 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms