RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 GFRA2O00451 464 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 MAP3K13O43283 966 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 LTFP02788 710 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 NDUFV2P19404 249 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SLC6A4P31645 630 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 USP8P40818 1118 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 IL12RB1P42701 662 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 FOXK2Q01167 660 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 TAF5Q15542 800 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 WFDC5Q8TCV5 224 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PIGKQ92643 395 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 HSFY1Q96LI6 401 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 GABRG3Q99928 467 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 VPS45Q9NRW7 570 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 STON1Q9Y6Q2 735 aa13.57□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 FAM170AA1A519 330 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 TM4SF5O14894 197 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 THAP12O43422 761 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 IGLV3-27P01718 113 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 NCAM1P13591 858 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SDHBP21912 280 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 GNA15P30679 374 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 IRX4P78413 519 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 STILQ15468 1287 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ADGRF1Q5T601 910 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 STPG1Q5TH74 334 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 NADSYN1Q6IA69 706 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SDE2Q6IQ49 451 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 GBP6Q6ZN66 633 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 IRGQQ8WZA9 623 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CYP8B1Q9UNU6 501 aa13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 E5RJQ4 531 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CYBBP04839 570 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 KCNA4P22459 653 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ITPKAP23677 461 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PRKCHP24723 683 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 HLA-FP30511 346 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 TBX4P57082 545 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ZNF234Q14588 700 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 EXOC3L4Q17RC7 722 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 FUT11Q495W5 492 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 MPPE1Q53F39 396 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 MIIPQ5JXC2 388 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PASD1Q8IV76 773 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ZNF366Q8N895 744 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa13.55□□□□□ -0.24
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HPS1-211ENST00000478087 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CIPCQ9C0C6 399 aa13.55□□□□□ -0.24
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HPS1-211ENST00000478087 FSCN3Q9NQT6 498 aa13.55□□□□□ -0.24
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HPS1-211ENST00000478087 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CACNA1EQ15878 2313 aa13.55□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 LNP1A1A4G5 178 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 C4orf47A7E2U8 309 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
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HPS1-211ENST00000478087 FBXO21O94952 628 aa13.54□□□□□ -0.24
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HPS1-211ENST00000478087 HLA-EP13747 358 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CLCN1P35523 988 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 TYRO3Q06418 890 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 KCNMA1Q12791 1236 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PPM1JQ5JR12 505 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.54□□□□□ -0.24
HPS1-211ENST00000478087 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.54□□□□□ -0.24
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