RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 TSPAN3O60637 253 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RHOBTB3O94955 611 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 KIF20AO95235 890 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 P4HA1P13674 534 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NR2F2P24468 414 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SLC14A1Q13336 389 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 KIF19Q2TAC6 998 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 HLA-BQ31612 363 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CBWD6Q4V339 395 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SDE2Q6IQ49 451 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GLRX5Q86SX6 157 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM124AQ86V42 546 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CPXM2Q8N436 756 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MYO19Q96H55 970 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TMEM245Q9H330 911 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GAREM1Q9H706 876 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 EBF2Q9HAK2 575 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CISHQ9NSE2 258 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 E7ENQ6 273 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 H0Y626 953 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 WNT9AO14904 365 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NDUFS2O75306 463 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TRIM16O95361 564 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CMA1P23946 247 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TKTL1P51854 596 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CLDN6P56747 220 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PDE4CQ08493 712 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CAMK2BQ13554 666 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PKDCCQ504Y2 493 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 EDEM1Q92611 657 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FOXJ1Q92949 421 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 UBXN6Q9BZV1 441 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RAXQ9Y2V3 346 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SNX11Q9Y5W9 270 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FAM149AA5PLN7 773 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 MEI4A8MW99 385 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 EPHX1P07099 455 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RALAP11233 206 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SLC6A4P31645 630 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 CD70P32970 193 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 COG7P83436 770 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ADAM9Q13443 819 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SHBQ15464 509 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 OR2T3Q8NH03 318 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 UBA3Q8TBC4 463 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TFAP2BQ92481 460 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 STOML2Q9UJZ1 356 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-206ENST00000474188 H0Y8X5 98 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 CBX4O00257 560 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PIK3R2O00459 728 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 WNT1P04628 370 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 FYNP06241 537 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 IGHV4-34P06331 123 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-206ENST00000474188 PSEN1P49768 467 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms