RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 CILPO75339 1184 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 GRAP2O75791 330 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SERPINE1P05121 402 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 EFNA5P52803 228 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC14Q49A88 953 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ARMC3Q5W041 872 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TMC7Q7Z402 723 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 UBA3Q8TBC4 463 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ACMSDQ8TDX5 336 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ATP9BO43861 1147 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CREB3O43889 395 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ZMPSTE24O75844 475 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ALDH1A2O94788 518 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PGM3O95394 542 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PRKCBP05771 671 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MYL4P12829 197 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MTTPP55157 894 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 FSTL1Q12841 308 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SNAPC2Q13487 334 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 STEAP4Q687X5 459 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CYS1Q717R9 158 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TEPSINQ96N21 525 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SCN4AP35499 1836 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CAPN8A6NHC0 703 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TXNDC9O14530 226 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ADCY6O43306 1168 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 GCATO75600 419 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 KRT34O76011 436 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CYP3A5P20815 502 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PROZP22891 400 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 DEUP1Q05D60 604 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TLR1Q15399 786 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM192Q8IY95 271 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 GCNAQ96QF7 691 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 IRAK4Q9NWZ3 460 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 BTBD7Q9P203 1132 aa10.66□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 VILLO15195 856 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 FDFT1P37268 417 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 RANBP1P43487 201 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PRKG1Q13976 671 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PACS1Q6VY07 963 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MARVELD2Q8N4S9 558 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PPP4R1Q8TF05 950 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 WDR27A2RRH5 827 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 DENRO43583 198 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ZBTB14O43829 449 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ASLP04424 464 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ICAM3P32942 547 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ALDH1A3P47895 512 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 HARS2P49590 506 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 INHBCP55103 352 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 BOLA3Q53S33 107 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 OR6B2Q6IFH4 312 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 C4orf22Q6V702 233 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 MPP4Q96JB8 637 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.65□□□□□ -0.7
LINC00886-201ENST00000472943 DCDC2Q9UHG0 476 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms