RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461827.5

APOBEC3G-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3G, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-202ENST00000461827 DCAF7P61962 342 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 VAMP2P63027 116 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 JAG1P78504 1218 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 TRPC3Q13507 836 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 PRSS36Q5K4E3 855 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 PRR31Q5SQ13 230 aa7□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 PLAG1Q6DJT9 500 aa7□□□□□ -1.29
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APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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APOBEC3G-202ENST00000461827 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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APOBEC3G-202ENST00000461827 DOCK1Q14185 1865 aa6.98□□□□□ -1.29
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APOBEC3G-202ENST00000461827 C12orf60Q5U649 245 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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APOBEC3G-202ENST00000461827 BBS12Q6ZW61 710 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 DEFB123Q8N688 67 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 ACER1Q8TDN7 264 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 RFFLQ8WZ73 363 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-202ENST00000461827 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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