RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCR3P51677 355 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBX4P57082 545 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NHLH1Q02575 133 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP2R5DQ14738 602 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARID5BQ14865 1188 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF3Q5VWG9 929 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZS52 159 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAC4Q86UU9 113 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DENND1CQ8IV53 801 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP33Q8TEY7 942 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSPY26PQ9H489 355 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEC1Q9P2X7 70 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HCN2Q9UL51 889 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC53A6NM62 1247 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAMTOR5O43504 91 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACSL4O60488 711 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LILRB5O75023 590 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC2A3P11169 496 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GZMAP12544 262 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXCR3P49682 368 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK17Q00537 523 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C5orf22Q49AR2 442 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MPPE1Q53F39 396 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DCAF6Q58WW2 860 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAA35Q5VZE5 725 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HGSNATQ68CP4 663 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYT13Q7L8C5 426 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DRC7Q8IY82 874 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TERB1Q8NA31 727 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMLNQ96KR4 655 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BBS2Q9BXC9 721 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H0Y858 1186 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAPN9O14815 690 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF40O75150 1001 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F9P00740 461 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APODP05090 189 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMBSP08397 361 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PYGBP11216 843 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC11A2P49281 568 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ENPP2Q13822 863 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A52Q3SY17 297 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARTNQ5T4W7 220 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRNP1Q6NT89 227 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SARM1Q6SZW1 724 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MON1BQ7L1V2 547 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TTC16Q8NEE8 873 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTN2A3PQ96KV6 586 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNKQ9P0W0 207 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRRT4C9JH25 899 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM24O15164 1050 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.6 ms