RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT1Q86TX2 421 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC30AQ86WT1 665 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 PPFIBP2Q8ND30 876 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 MCUQ8NE86 351 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC39Q96DD0 335 aa19.28■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB7Q9H672 318 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A6Q9P2U8 582 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 RAP1GDS1P52306 607 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC4P56524 1084 aa19.28■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf46Q6P387 395 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 CRHR1P34998 444 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP1BP68106 108 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A3Q01959 620 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 AMHR2Q16671 573 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SMYD5Q6GMV2 418 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRF2Q8IZF7 708 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF670Q9BS34 389 aa19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEC1O60732 1142 aa19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 RBP5P82980 135 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 AP1B1Q10567 949 aa19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 KCNT2Q6UVM3 1135 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 APOL6Q9BWW8 343 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 VTA1Q9NP79 307 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT82Q9NSB4 513 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF212Q9UDV6 495 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K7O43318 606 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 STRNO43815 780 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 PANX3Q96QZ0 392 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 MDM4O15151 490 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 GSTA2P09210 222 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SP100P23497 879 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP7Q8WX94 980 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF12Q96FN5 646 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL16Q9H2A7 254 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA11Q9UKX5 1188 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1257Q9ULG3 409 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 A6NJR5 290 aa19.25■□□□□ 0.67
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