RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413164.6

SLC13A3-204, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC13A3, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-204ENST00000413164 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 HHLA1C9JL84 531 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 E7ENQ6 273 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 MFSD11O43934 449 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 MGEA5O60502 916 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 ASGR1P07306 291 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 CNPY4Q8N129 248 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 H3BRJ5 948 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 INHAP05111 366 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 DEUP1Q05D60 604 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 DPYSQ14117 519 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 DSC3Q14574 896 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-204ENST00000413164 A0A0A0MRY4 1105 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 GSTA1P08263 222 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PRKCHP24723 683 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 CD52P31358 61 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 THPOP40225 353 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 RAB27AP51159 221 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 RABGGTBP53611 331 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 AIF1P55008 147 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PTK7Q13308 1070 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 NTAN1Q96AB6 310 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SPATA13Q96N96 652 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 LGMNQ99538 433 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 GSTA2P09210 222 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SCAPQ12770 1279 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SEMA3BQ13214 749 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 NME3Q13232 169 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF276Q8N554 614 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 CFAP36Q96G28 342 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 HTTP42858 3142 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 A0A0U1RQF3 1178 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 I6L893 689 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 TM9SF1O15321 606 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 FAM155BO75949 473 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 PCSK1P29120 753 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ADRA1BP35368 520 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 GLUD2P49448 558 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC20A2Q08357 652 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 DNAJC3Q13217 504 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 KCNA10Q16322 511 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SPOCK2Q92563 424 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 COX16Q9P0S2 106 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 H0YHG0 523 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 DCLK1O15075 740 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 INHBAP08476 426 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 FAAP100Q0VG06 881 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 RFX8Q6ZV50 586 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 APOEP02649 317 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP11A1P05108 521 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms