RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM136A	Q96C01	138 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TBCB	Q99426	244 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KLC2	Q9H0B6	622 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FETUB	Q9UGM5	382 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		I3L4J1	428 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CREB3	O43889	395 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	BEST1	O76090	585 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PRKCH	P24723	683 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NUMB	P49757	651 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PDE1B	Q01064	536 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC6A3	Q01959	620 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	USP4	Q13107	963 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TFDP2	Q14188	446 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KCNN1	Q92952	543 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM167A	Q96KS9	214 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM72C	H0Y354	149 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		I6L893	689 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	DNAJC6	O75061	913 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	BPGM	P07738	259 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TGFB3	P10600	412 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ARSA	P15289	507 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PSMB4	P28070	264 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	IRF9	Q00978	393 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ARHGAP1	Q07960	439 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	AP1B1	Q10567	949 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PPP2R5D	Q14738	602 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RAPH1	Q70E73	1250 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM72B	Q86X60	149 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF169	Q8NCN4	708 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	AGAP2	Q99490	1192 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF39	Q9H2S5	420 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SYBU	Q9NX95	663 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A0G2JMZ2	1700 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM159B	A6NKW6	160 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	IL18RAP	O95256	599 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	VHL	P40337	213 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC34A1	Q06495	639 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	INCA1	Q0VD86	236 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	STX3	Q13277	289 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TUBB3	Q13509	450 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	KCTD2	Q14681	263 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	LPCAT4	Q643R3	524 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	CCNY	Q8ND76	341 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CAGE1-203	ENST00000379918	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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