RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ERICH1Q86X53 443 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 XYLT1Q86Y38 959 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ALLCQ8N6M5 410 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 BAP1Q92560 729 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ACDQ96AP0 544 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 SGK1O00141 431 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINC1P01008 464 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.087e-6■□□□□ 10.7
CSAG1-201ENST00000361211 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF4P43489 277 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 NR1I3Q14994 352 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRF1Q5T601 910 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 DDI1Q8WTU0 396 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 C18orf8Q96DM3 657 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 COX16Q9P0S2 106 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG1-201ENST00000361211 PIEZO1Q92508 2521 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PQC6 194 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM23O75077 832 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 CYBBP04839 570 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 SLC11A2P49281 568 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 NRLP54845 237 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 SNX16P57768 344 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 TPM4P67936 248 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 CDK17Q00537 523 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 GEN1Q17RS7 908 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 MPPE1Q53F39 396 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 TRNP1Q6NT89 227 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 LONP2Q86WA8 852 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 AZIN2Q96A70 460 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 ACOX2Q99424 681 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 DDIT4Q9NX09 232 aa15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC53A6NM62 1247 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 GFRA3O60609 400 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 TBL1XO60907 577 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 CAVIN2O95810 425 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 APOEP02649 317 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA6P31267 233 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 NOS2P35228 1153 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 FLT3P36888 993 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 SCNN1AP37088 669 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 PBX1P40424 430 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 WASP42768 502 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 PTP4A2Q12974 167 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.49■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 HRO43593 1189 aa15.49■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 GJB6O95452 261 aa15.49■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 FERP16591 822 aa15.49■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 MMP8P22894 467 aa15.49■□□□□ 0.07
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-FP30511 346 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms