RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356175.7

NF1-201, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 12,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-201ENST00000356175 CCDC74BQ96LY2 380 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 LRMDAQ9H2I8 198 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 PIK3R1P27986 724 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TAP1Q03518 808 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 NADK2Q4G0N4 442 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 EPC2Q52LR7 807 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FAXCQ5TGI0 409 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 BROXQ5VW32 411 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FNIP1Q8TF40 1166 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ZNF12P17014 697 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TNS4Q8IZW8 715 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 STARD8Q92502 1023 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ZNF560Q96MR9 790 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 AGAP3Q96P47 875 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 SHPRHQ149N8 1683 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 RAD17O75943 681 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 UNC5CO95185 931 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 MTFR1Q15390 333 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 COPS6Q7L5N1 327 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 RIT1Q92963 219 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CDRT15Q96T59 188 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CASS4Q9NQ75 786 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FKBP9O95302 570 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 GNG2P59768 71 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CHRNDQ07001 517 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ULK1O75385 1050 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 APRTP07741 180 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 PPP3CCP48454 512 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 AMPD2Q01433 879 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 WEE2P0C1S8 567 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TSPAN19P0C672 248 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 S100A2P29034 98 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 SLC26A3P40879 764 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 KCNJ6P48051 423 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 DSG2Q14126 1118 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FAM47BQ8NA70 645 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 NUAK2Q9H093 628 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 MMRN1Q13201 1228 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 DSC3Q14574 896 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 SMCO1Q147U7 214 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 COQ8AQ8NI60 647 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CRELD1Q96HD1 420 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 HGH1Q9BTY7 390 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 OCEL1Q9H607 264 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ADGRL2O95490 1459 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 KPNA7A9QM74 516 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ABLIM1O14639 778 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 OIP5O43482 229 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ABL1P00519 1130 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 UGP2Q16851 508 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 FAM160B2Q86V87 743 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TMEM87BQ96K49 555 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 GRIN2DO15399 1336 aa6.99□□□□□ -1.29
NF1-201ENST00000356175 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms