RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 DDR2Q16832 855 aa26.56■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 TRIM66O15016 1216 aa26.56■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 ALOX15BO15296 676 aa26.56■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 TPI1P60174 286 aa26.56■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 DMTNQ08495 405 aa26.56■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 KCNJ11Q14654 390 aa26.56■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 PGFP49763 221 aa26.55■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 ARPP19P56211 112 aa26.55■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 DCLK1O15075 740 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 CHADO15335 359 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 UPP2O95045 317 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 AGTP01019 485 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 IGLV3-25P01717 112 aa26.54■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 MTM1Q13496 603 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 MSS51Q4VC12 460 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 RTP2Q5QGT7 225 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 SCD5Q86SK9 330 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 PDIK1LQ8N165 341 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 TTC9BQ8N6N2 239 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 NETO2Q8NC67 525 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 SERPINB12Q96P63 405 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 LGMNQ99538 433 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 KLC2Q9H0B6 622 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.54■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 ANKMY2Q8IV38 441 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 NUP93Q8N1F7 819 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 TBX21Q9UL17 535 aa26.54■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 IRAK2O43187 625 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 IVLP07476 585 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 VAV1P15498 845 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 ERCC2P18074 760 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 MAGEA11P43364 429 aa26.53■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.53■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.53■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 OR12D3Q9UGF7 316 aa26.53■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 EPAS1Q99814 870 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 CCDC77Q9BR77 488 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa26.53■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 SNX10Q9Y5X0 201 aa26.53■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 IKBKEQ14164 716 aa26.51■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 ETNK1Q9HBU6 452 aa26.51■■□□□ 1.84
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