RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNA4P22459 653 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC6A4P31645 630 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 MLKLQ8NB16 471 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRGPRX1Q96LB2 322 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIX2Q9NPC8 291 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYP8B1Q9UNU6 501 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 THAP12O43422 761 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKCHP24723 683 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 HLA-FP30511 346 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 GNA15P30679 374 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF234Q14588 700 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 FUT11Q495W5 492 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 MPPE1Q53F39 396 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADGRF1Q5T601 910 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF43Q68DV7 783 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 NADSYN1Q6IA69 706 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAM32Q8TC27 787 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 CIPCQ9C0C6 399 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDH15Q96QU1 1955 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 E5RJQ4 531 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO21O94952 628 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCAM1P13591 858 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITPKAP23677 461 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PON1P27169 355 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP8P40818 1118 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBX4P57082 545 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 IRX4P78413 519 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENPP2Q13822 863 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL31Q6EBC2 164 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 GBP6Q6ZN66 633 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAC4Q86UU9 113 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SHC3Q92529 594 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC2A11Q9BYW1 496 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 FSCN3Q9NQT6 498 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 C4orf47A7E2U8 309 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 LATS1O95835 1130 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 HLA-EP13747 358 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAF5Q15542 800 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 LYSMD4Q5XG99 296 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACUL1Q86Y37 369 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 PASD1Q8IV76 773 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA1Q92805 767 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACSL4O60488 711 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBL1XO60907 577 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 RING1Q06587 406 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDCLQ13371 301 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIM61Q5EBN2 209 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MIIPQ5JXC2 388 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF366Q8N895 744 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 UCMAQ8WVF2 138 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 THAP9Q9H5L6 903 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUMA1Q14980 2115 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MED7O43513 233 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADRB1P08588 477 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms