RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EPC1Q9H2F5 836 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 WDR27A2RRH5 827 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CCDC188H7C350 402 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FSCN2O14926 492 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PRPSAP2O60256 369 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FYNP06241 537 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PTPN7P35236 360 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HDAC4P56524 1084 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARPC4P59998 168 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 COPS2P61201 443 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ROR1Q01973 937 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ODF2Q5BJF6 829 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PACS1Q6VY07 963 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BNIPLQ7Z465 357 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 STKLD1Q8NE28 680 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RAPGEF5Q92565 580 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HSPH1Q92598 858 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DPF3Q92784 378 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NT5C3BQ969T7 300 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPACA7Q96KW9 195 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KRT12Q99456 494 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RAD9AQ99638 391 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 STK39Q9UEW8 545 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RASA4BC9J798 803 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TLL1O43897 1013 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SOAT2O75908 522 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FGF18O76093 207 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 URODP06132 367 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RARAP10276 462 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RALAP11233 206 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KDELR1P24390 212 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OR1D2P34982 312 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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CCR6-201ENST00000341935 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.28□□□□□ -1.4
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CCR6-201ENST00000341935 NUP93Q8N1F7 819 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TEKT4Q8WW24 435 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NACC2Q96BF6 587 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCYL1Q96KG9 808 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NPY6RQ99463 290 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NR2E1Q9Y466 385 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LRRD1A4D1F6 860 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CAPN9O14815 690 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ENDOD1O94919 500 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CETN2P41208 172 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KRT17Q04695 432 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KCTD6Q8NC69 237 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCML2Q9UQR0 700 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GBF1Q92538 1859 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PHF2O75151 1096 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TUBBP07437 444 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NCAM1P13591 858 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ENPP1P22413 925 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CDKN2BP42772 138 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ARSEP51690 589 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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