RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 OVOS1Q6IE37 1185 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4X1Q8N118 509 aa27.3■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 APPL2Q8NEU8 664 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10T2Q8NGX3 314 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG4AQ8WYN0 398 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-CQ95604 372 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 GDAP2Q9NXN4 497 aa27.3■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 OAZ2O95190 189 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFV1P49821 464 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 OSTM1Q86WC4 334 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX9Q8N6V9 391 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADH1AP07327 375 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT5P13647 590 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 AP3M2P53677 418 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 CMPK2Q5EBM0 449 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPR65Q8IYL9 337 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 STK38LQ9Y2H1 464 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SCINQ9Y6U3 715 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK6Q96HP0 2047 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ROR1Q01973 937 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 MGAT5Q09328 741 aa27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 RALAP11233 206 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 TYMPP19971 482 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 RRM1P23921 792 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3CAP42336 1068 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC8B1Q6J4K2 584 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF2BQ8N4N8 673 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF398Q8TD17 642 aa27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF280DQ6N043 979 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 VSIG1Q86XK7 387 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 FAXDC2Q96IV6 333 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 FETUBQ9UGM5 382 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL2O75678 378 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LMO2P25791 158 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF699Q32M78 642 aa27.26■■□□□ 1.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 MON1BQ7L1V2 547 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMS2Q7Z4I7 341 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 MSLNLQ96KJ4 702 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF570Q96NI8 536 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PHACTR1Q9C0D0 580 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SMYD3Q9H7B4 428 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 MAN1C1Q9NR34 630 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TBK1Q9UHD2 729 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC24A2Q9UI40 661 aa27.26■■□□□ 1.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 GLUD1P00367 558 aa27.26■■□□□ 1.95
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CAPNS1-201ENST00000246533 RAB33AQ14088 237 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED2Q15363 201 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRTM3Q86VH5 581 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ERICH1Q86X53 443 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
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