RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrf2E9Q4J9 644 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Farp1F8VPU2 1048 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt4O08832 578 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifnar2O35664 513 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01650 108 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01653 108 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam167bP17257 162 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp10P52479 792 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fermt1P59113 677 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DselQ0VBN2 1207 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsdmc4Q3TR54 480 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8773Q3UQ24 132 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PostnQ62009 838 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabbr2Q80T41 940 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chn2Q80XD1 332 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 McmbpQ8R3C0 642 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isl2Q9CXV0 359 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map2k5Q9WVS7 448 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Diaph3Q9Z207 1171 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef10Q8C033 1345 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp236S4R299 1847 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc13D3YV10 709 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apold1E9Q0X2 246 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3460E9QAI8 215 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7694J3QNH8 270 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CidebO70303 219 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppargc1aO70343 797 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acvr2bP27040 536 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AmhP27106 555 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dynlt1P51807 113 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts1P97857 968 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xlr3cQ61806 226 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripor1Q68FE6 1223 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Podnl1Q6P3Y9 559 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnt2Q7TQK0 723 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw21Q8BI38 468 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx30Q8CE50 437 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr98Q8VC42 657 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FcrlaQ920A9 352 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpp3Q99KK7 738 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gimap3Q99MI6 301 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdap2Q9DBL2 498 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timp4Q9JHB3 224 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpxm1Q9Z100 722 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ror2Q9Z138 944 aa13.06□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcp11x2A2AEI7 503 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxb9A2BI93 185 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl7cO08664 217 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pbx3O35317 434 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnrh1P13562 90 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp42P22227 288 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npas2P97460 816 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam172aQ3TNH5 417 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces5aQ6AW46 575 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 March4Q80TE3 409 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr11Q8K1X1 1223 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arfip2Q8K221 341 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgbl1Q8VDV0 494 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb2Q91Y00 799 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CPS8 106 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Them5Q9CQJ0 248 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Homer2Q9QWW1 354 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh18a1Q9Z110 795 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btnl4A2CG29 586 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm16430A6X8J1 155 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtproE9Q612 1226 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10722F6VLK5 217 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek2O35942 443 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept7O55131 436 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc10a3P21129 473 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabrb2P63137 512 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PterQ60866 349 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp4aQ64436 1033 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ShbQ6PD21 503 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GnasQ6R0H7 1133 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrlQ7TQ48 910 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr212Q7TS33 327 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd10Q80X66 475 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Impg2Q80XH2 1243 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd45Q810N6 248 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NfascQ810U3 1240 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amz1Q8BVF9 502 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc39bQ8BYY4 617 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slxl1Q9D515 155 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxe3Q9QY14 288 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa13.05□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2t4E9PWV0 503 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc24a2Q14BI1 711 aa13.04□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aarsd1Q3THG9 412 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms