RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CD6P30203 668 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RAD23BP54727 409 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FAM193AP78312 1265 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHG6Q3KR16 790 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RAB41Q5JT25 222 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PIGZQ86VD9 579 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP18Q8N392 663 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM176AQ96HP8 235 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SUSD2Q9UGT4 822 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA1GO43497 2377 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 IL12RB1P42701 662 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 WDR45BQ5MNZ6 344 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 DENND1CQ8IV53 801 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL13Q8NEE6 735 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ITM2CQ9NQX7 267 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 RAB20Q9NX57 234 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 KLK13Q9UKR3 277 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 MSRB2Q9Y3D2 182 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 PKD1L2Q7Z442 2459 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 FREM2Q5SZK8 3169 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 H0Y626 953 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 GJB3O75712 270 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM16O95361 564 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 GNSP15586 552 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 MXI1P50539 228 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SLC14A1Q13336 389 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 EDRF1Q3B7T1 1238 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 CPXM2Q8N436 756 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD52Q8NB46 1076 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 UCMAQ8WVF2 138 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 DNASE2BQ8WZ79 361 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ARID3AQ99856 593 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ELOVL2Q9NXB9 296 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 CYBBP04839 570 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 MAOBP27338 520 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 FAM217AQ8IXS0 508 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC4EQ9ULY5 219 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQ27 194 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQ64 194 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SLC12A8A0AV02 714 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ18B7U540 433 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TKTL1P51854 596 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 E2F5Q15329 346 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS6Q8IU80 811 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 CADM4Q8NFZ8 388 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TATDN2Q93075 761 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A11Q9BYW1 496 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 DSPP15924 2871 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 STX10O60499 249 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZBED1O96006 694 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 NCAM1P13591 858 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TPMTP51580 245 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SLC8A3P57103 927 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF234Q14588 700 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 PLD4Q96BZ4 506 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SIPA1Q96FS4 1042 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 GPR174Q9BXC1 333 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SH3BP5O60239 455 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF202O95125 648 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 OXTRP30559 389 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 GRIK2Q13002 908 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM215Q68D42 235 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 DDI1Q8WTU0 396 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GTW7 788 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 MEI4A8MW99 385 aa26.07■■□□□ 1.76
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