RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	KNL1	Q8NG31	2342 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393		E7ENQ6	273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393		O00370	1275 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	AP5Z1	O43299	807 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SMC2	O95347	1197 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PRKCH	P24723	683 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FMO5	P49326	533 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SGSH	P51688	502 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BCAT1	P54687	386 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	COG7	P83436	770 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM215	Q68D42	235 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SDE2	Q6IQ49	451 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BIN1	O00499	593 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	HLA-E	P13747	358 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	LCP1	P13796	627 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BMP6	P22004	513 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MAOB	P27338	520 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SHC2	P98077	582 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF366	Q8N895	744 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393		M0QYV0	167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CHKA	P35790	457 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	STX17	P56962	302 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC8A3	P57103	927 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	LMAN2	Q12907	356 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF234	Q14588	700 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	STARD3	Q14849	445 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PLD4	Q96BZ4	506 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.47	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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