RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GCM1Q9NP62 436 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 DAPP1Q9UN19 280 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR34Q9UPC5 381 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SBF2Q86WG5 1849 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 E9PLN8 166 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NRP1O14786 923 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PEX10O60683 326 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 AGFG2O95081 481 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF20AO95235 890 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE8BO95263 885 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMB1P07942 1786 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA6P08133 673 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP21A2P08686 494 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF28P17035 718 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB5P18084 799 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT1P21579 422 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KLRK1P26718 216 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MST1P26927 711 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ADORA1P30542 326 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD12P35452 270 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CRKLP46109 303 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GZMKP49863 264 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 EPHB3P54753 998 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TCF15Q12870 199 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNG2Q16589 344 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 VWA3BQ502W6 1294 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA1AQ53H76 456 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT40Q6A162 431 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF605Q86T29 641 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RTL9Q8NET4 1388 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TMIEQ8NEW7 156 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GPT2Q8TD30 523 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF3C6Q969F1 213 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS16Q9H269 839 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NELFAQ9H3P2 528 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CHODLQ9H9P2 273 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CTNNA3Q9UI47 895 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR6Q9Y217 621 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF3AQ9Y496 699 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SYCE3A1L190 88 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2W5A6NFC9 320 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 E7EWF7 191 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DOK2O60496 412 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT38O76015 456 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMTA2O94983 1202 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CHEK2O96017 543 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AMHP03971 560 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP2C9P11712 490 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms