RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565160.5

BBS4-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 681 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-208	ENST00000565160	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	LRBA	P50851	2863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS4-208	ENST00000565160	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MYH1	P12882	1939 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ZNF185	O15231	689 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MATN3	O15232	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GRM6	O15303	877 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TSPAN6	O43657	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	STX6	O43752	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PRSS23	O95084	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ADORA2A	P29274	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GYG1	P46976	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MAP2K6	P52564	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	UBE2H	P62256	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NHLH2	Q02577	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GCKR	Q14397	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GPNMB	Q14956	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RAB39A	Q14964	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GGN	Q86UU5	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	AP1G1	O43747	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	DTNB	O60941	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	OFD1	O75665	1012 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CAVIN2	O95810	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	POMC	P01189	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ITGB1	P05556	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TPM2	P07951	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RARB	P10826	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MAL	P21145	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NR4A1	P22736	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MGAT1	P26572	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ICAM3	P32942	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	BACE1	P56817	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FAM189B	P81408	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	HYAL1	Q12794	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FOXE3	Q13461	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MED25	Q71SY5	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RGMA	Q96B86	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MYD88	Q99836	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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