RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RARB	P10826	455 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ARL4A	P40617	200 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BMPR2	Q13873	1038 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	STRADA	Q7RTN6	431 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		19.02	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH1A2	O94788	518 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NAB1	Q13506	487 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TEX44	Q53QW1	395 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MROH9	Q5TGP6	573 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STEAP4	Q687X5	459 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf31	Q8N865	590 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CDKL2	Q92772	493 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	OPTN	Q96CV9	577 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	HSFY1	Q96LI6	401 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SNTG2	Q9NY99	539 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DTL	Q9NZJ0	730 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TRIP11	Q15643	1979 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0A0MRY4	1105 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y3Z8	333 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A9	O60656	530 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1C1	P21283	382 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC6	Q16204	474 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STKLD1	Q8NE28	680 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA13	Q96N96	652 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NAT9	Q9BTE0	207 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MECR	Q9BV79	373 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	THAP1	Q9NVV9	213 aa		19.01	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PPEF2	O14830	753 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	WASHC5	Q12768	1159 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	BLMH	Q13867	455 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RINL	Q6ZS11	566 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2A3	Q93084	1043 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	OLFM3	Q96PB7	478 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NME7	Q9Y5B8	376 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	HMX2	A2RU54	273 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN14	A8MX76	684 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DGKI	O75912	1065 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CD4	P01730	458 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STX3	Q13277	289 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NOTUM	Q6P988	496 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TTC7B	Q86TV6	843 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MPP5	Q8N3R9	675 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STMN2	Q93045	179 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		19	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEC1	O60732	1142 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	OPHN1	O60890	802 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	LCP1	P13796	627 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ACADS	P16219	412 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	VHL	P40337	213 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		18.99	■□□□□ 0.63

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