RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CASC1	Q6TDU7	716 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX9	Q8N6V9	391 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM71B	Q8TC56	605 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HTRA1	Q92743	480 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SMO	Q99835	787 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PREB	Q9HCU5	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM160	Q9NX00	188 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AASS	Q9UDR5	926 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPL8	197 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF785	A8K8V0	405 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LGALS16	A8MUM7	142 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		B4DLN1	442 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GJB1	P08034	283 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFR2	P21802	821 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DRD4	P21917	467 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CHM	P24386	653 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFV1	P49821	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TUB	P50607	506 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCB4	Q15147	1175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF5	Q15542	800 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP58	Q5T655	872 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX32	Q86XE0	403 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF566	Q969W8	418 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GDF15	Q99988	308 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPO	Q9BU64	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LRFN1	Q9P244	771 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPH5	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		F5H697	171 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		F8W8V4	182 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SOCS2	O14508	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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