RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 PGFP49763 221 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 COPAP53621 1224 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MFAP3P55082 362 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MAP3K7CLP57077 242 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KCNH2Q12809 1159 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ORC1Q13415 861 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LY6DQ14210 128 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SURF1Q15526 300 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BROXQ5VW32 411 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 HTR3DQ70Z44 454 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 EID2Q8N6I1 236 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF366Q8N895 744 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 RDH13Q8NBN7 331 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MARK1Q9P0L2 795 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KIF3AQ9Y496 699 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KNL1Q8NG31 2342 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 C2orf72A6NCS6 295 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NPC1O15118 1278 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PCDHGA12O60330 932 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PHACTR2O75167 634 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TACC1O75410 805 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CYBBP04839 570 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ADORA2BP29275 332 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CTSKP43235 329 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BCAT1P54687 386 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TLE3Q04726 772 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PCSK4Q6UW60 755 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 WDR49Q8IV35 697 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PLPP6Q8IY26 295 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 OR2T3Q8NH03 318 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FGF11Q92914 225 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BIRC7Q96CA5 298 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SLC6A18Q96N87 628 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.48□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1B0GTQ1 180 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1W2PQH9 124 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GREM1O60565 184 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BEST1O76090 585 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KIF20AO95235 890 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 IGLV3-19P01714 112 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 DNTTP04053 509 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 RARGP13631 454 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GLDCP23378 1020 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CD27P26842 260 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ACADVLP49748 655 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CYP2J2P51589 502 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF132P52740 706 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TMPRSS3P57727 454 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MYL6P60660 151 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BIRC3Q13489 604 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ALCAMQ13740 583 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 E2F5Q15329 346 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF699Q32M78 642 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SV2BQ7L1I2 683 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ACOT1Q86TX2 421 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 DDI1Q8WTU0 396 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 EPSTI1Q96J88 318 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TNIP3Q96KP6 325 aa8.47□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CGRRF1Q99675 332 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms