RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	MECR	Q9BV79	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	COL15A1	P39059	1388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PS29	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NCN8	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CER1	O95813	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	YY1	P25490	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RBL1	P28749	1068 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ADRA1B	P35368	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NPTX2	P47972	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	LENG9	Q96B70	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DERA	Q9Y315	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308		F5H697	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	STX16	O14662	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM20B	O75063	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	VNN1	O95497	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GC	P02774	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PROZ	P22891	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINA4	P29622	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CD6	P30203	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CDK7	P50613	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE6C	P51160	858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MTAP	Q13126	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TOMM20	Q15388	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CLIP1	P30622	1438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TIMM44	O43615	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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