RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	DLG4	P78352	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM189B	P81408	668 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GRIK3	Q13003	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAM9	Q13443	819 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SURF1	Q15526	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CD302	Q8IX05	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ALG3	Q92685	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SNX27	Q96L92	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RAD9A	Q99638	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TTC3	P53804	2025 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CIT	O14578	2027 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BECN2	A8MW95	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GSTA4	O15217	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MAPK13	O15264	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM189A1	O60320	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	STX10	O60499	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MAFK	O60675	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TADA3	O75528	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CAVIN2	O95810	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GNA14	O95837	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	POMC	P01189	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TNNC2	P02585	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CA3	P07451	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	NCAM1	P13591	858 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LAG3	P18627	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TNNI1	P19237	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PPM1A	P35813	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TNFSF9	P41273	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC6A11	P48066	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GATM	P50440	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SCNN1G	P51170	649 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	VAMP7	P51809	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	STX17	P56962	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TPM4	P67936	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MYL5	Q02045	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DMTN	Q08495	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TUSC3	Q13454	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	NFIL3	Q16649	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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