RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533666.5

CMTM1-217, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 493 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-217ENST00000533666 PFKPQ01813 784 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 PPP2R5DQ14738 602 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ACAP1Q15027 740 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 HTR3DQ70Z44 454 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 STRADAQ7RTN6 431 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 EMC1Q8N766 993 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ADAM32Q8TC27 787 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 RFFLQ8WZ73 363 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 IRF7Q92985 503 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 AZIN2Q96A70 460 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 WDCPQ9H6R7 721 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 BRD9Q9H8M2 597 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 TTC28Q96AY4 2481 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 CHADO15335 359 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 STC2O76061 302 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 IGLV3-25P01717 112 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 CHKAP35790 457 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ATP11AP98196 1134 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 KIF5AQ12840 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 NR1H3Q13133 447 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 CCDC14Q49A88 953 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 VITQ6UXI7 678 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ATP2A3Q93084 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 TBCBQ99426 244 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 COX16Q9P0S2 106 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.65□□□□□ -0.06
CMTM1-217ENST00000533666 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ENDOD1O94919 500 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 GJB6O95452 261 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 NFATC1O95644 943 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 IGLV3-27P01718 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CCDC175P0C221 793 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 GDI1P31150 447 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ARHGAP25P42331 645 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CXCR3P49682 368 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 VAV2P52735 878 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 AMPD2Q01433 879 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CDO1Q16878 200 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 POTEHQ6S545 545 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 RNF135Q8IUD6 432 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 EXOC4Q96A65 974 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 SLC39A13Q96H72 371 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ADH1CP00326 375 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ASGR2P07307 311 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 SRFP11831 508 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 AIF1P55008 147 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 GRM2Q14416 872 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 TCEAL1Q15170 157 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ADGRF1Q5T601 910 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 DENND1CQ8IV53 801 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CPA6Q8N4T0 437 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 DNASE1L2Q92874 299 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 PIGVQ9NUD9 493 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 CCP110O43303 1012 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-217ENST00000533666 ACSL4O60488 711 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms