RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PLK2Q9NYY3 685 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HRO43593 1189 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 LATS1O95835 1130 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TPM2P07951 284 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT9P35527 623 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 JAM2P57087 298 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 RING1Q06587 406 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SYCP1Q15431 976 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TAF5Q15542 800 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 GOLGA1Q92805 767 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 BHMTQ93088 406 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 EML5Q05BV3 1969 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 IGLV3-25P01717 112 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ERBB2P04626 1255 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 NNTQ13423 1086 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC39A13Q96H72 371 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HHIPQ96QV1 700 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF292O60281 2723 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PRRT4C9JH25 899 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TIE1P35590 1138 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ADGRF1Q5T601 910 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TAC4Q86UU9 113 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ALLCQ8N6M5 410 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SGK1O00141 431 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ADAM23O75077 832 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 GLI1P08151 1106 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 DGKGP49619 791 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF165P49910 485 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TBX4P57082 545 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 UBXN1Q04323 297 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 IQCB1Q15051 598 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ADAM32Q8TC27 787 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 AZIN2Q96A70 460 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SERPINB11Q96P15 392 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 NOX5Q96PH1 765 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 EBF1Q9UH73 591 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 CNR2P34972 360 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 SOX5P35711 763 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 CRY1Q16526 586 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 TAF3Q5VWG9 929 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 RNF43Q68DV7 783 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC43A3-217ENST00000530005 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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