RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	LPXN	O60711	386 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PHF2	O75151	1096 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	F11	P03951	625 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	C8A	P07357	584 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	UQCRH	P07919	91 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CCR1	P32246	355 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CA8	P35219	290 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HCAR3	P49019	387 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CCNG2	Q16589	344 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KRT12	Q99456	494 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	GBF1	Q92538	1859 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TLR5	O60602	858 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TBX18	O95935	607 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HOXA9	P31269	272 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CHRNA3	P32297	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	RING1	Q06587	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KRT81	Q14533	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	COL6A3	P12111	3177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CST8	O60676	142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ZMYND10	O75800	440 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PAPLN	O95428	1278 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	LRG1	P02750	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLC2A3	P11169	496 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FNTA	P49354	379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TFDP2	Q14188	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TAF12	Q16514	161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KAZN	Q674X7	775 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-215	ENST00000529766	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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