RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 VPS16Q9H269 839 aa5.51□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 A2MP01023 1474 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ZNF521Q96K83 1311 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 CEP162Q5TB80 1403 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 CLCA1A8K7I4 914 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 E5RJQ4 531 aa5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 PPEF2O14830 753 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 WDR47O94967 919 aa5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 GPS1Q13098 491 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 COL15A1P39059 1388 aa5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 NTSR1P30989 418 aa5.49□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.49□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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RBM39-241ENST00000496183 FAM50BQ9Y247 325 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RBM39-241ENST00000496183 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.47□□□□□ -1.53
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