RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SGK1	O00141	431 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC30A4	O14863	429 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM44	O43615	452 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CYBB	P04839	570 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A1	P19634	815 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PON1	P27169	355 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TIE1	P35590	1138 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ACADSB	P45954	432 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKG	P49619	791 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC13	P55735	322 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DAOA	P59103	153 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MESP2	Q0VG99	397 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	EFEMP1	Q12805	493 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MIIP	Q5JXC2	388 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MIB1	Q86YT6	1006 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TFAP2B	Q92481	460 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRG3	Q99928	467 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS45	Q9NRW7	570 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MED7	O43513	233 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM23	O75077	832 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT5	P13647	590 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF18	P17022	549 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY2	P41231	377 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RING1	Q06587	406 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ADIG	Q0VDE8	80 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NNT	Q13423	1086 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NCAPH	Q15003	741 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MPP7	Q5T2T1	576 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	FYB2	Q5VWT5	728 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PMS2CL	Q68D20	193 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NAT16	Q8N8M0	369 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SPACA7	Q96KW9	195 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		18.05	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A8	A0AV02	714 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TULP2	O00295	520 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MDM4	O15151	490 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF217	O75362	1048 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINC1	P01008	464 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	UBXN1	Q04323	297 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KDSR	Q06136	332 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ENPP2	Q13822	863 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MPPE1	Q53F39	396 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	EMC10	Q5UCC4	262 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PMF1	Q6P1K2	205 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	UBA3	Q8TBC4	463 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA1	Q92805	767 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CBX8	Q9HC52	389 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		18.04	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS16	A8MUM7	142 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		E7ENQ6	273 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	IRAK2	O43187	625 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	C7	P10643	843 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD12	P35452	270 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	USP8	P40818	1118 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	GPD2	P43304	727 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCB1	Q15051	598 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF43	Q68DV7	783 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO7	Q6IWH7	933 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	UCMA	Q8WVF2	138 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		18.03	■□□□□ 0.48

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