RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486234.1

AUP1-208, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, human

TSL 5

Gene AUP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AUP1-208	ENST00000486234	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234		M0QYT0	321 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	TNFRSF10A	O00220	468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ARNTL	O00327	626 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	GREM1	O60565	184 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ENDOD1	O94919	500 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ADH1C	P00326	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CYP1A2	P05177	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ABCB4	P21439	1286 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	GPD1	P21695	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RUNX3	Q13761	415 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	EML3	Q32P44	896 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	REV3L	O60673	3130 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	IRF1	P10914	325 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	FLT3	P36888	993 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CXCR3	P49682	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	SULT1E1	P49888	294 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	GALC	P54803	685 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RNF34	Q969K3	372 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	KLKB1	P03952	638 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CYBB	P04839	570 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	HMBS	P08397	361 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	AIF1	P55008	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	KRT83	P78385	493 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	GAD2	Q05329	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	NME3	Q13232	169 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	NELL2	Q99435	816 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MYO1F	O00160	1098 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	ACSL4	O60488	711 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RNF8	O76064	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	NDUFA10	O95299	355 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	MAGEA1	P43355	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AUP1-208	ENST00000486234	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23

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