RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	SIX5	Q8N196	739 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TBCB	Q99426	244 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NPY6R	Q99463	290 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019		M0R296	226 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GREM1	O60565	184 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	F9	P00740	461 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	DES	P17661	470 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GPD1	P21695	349 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CCR1	P32246	355 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CHKA	P35790	457 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SOX9	P48436	509 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC11A2	P49281	568 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ATP11A	P98196	1134 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	AMPD2	Q01433	879 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RING1	Q06587	406 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	DHCR24	Q15392	516 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CDO1	Q16878	200 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ANO4	Q32M45	955 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	IER5L	Q5T953	404 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019		Q6ZNB5	142 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SHD	Q96IW2	340 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ACSL4	O60488	711 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ADH1C	P00326	375 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CYBB	P04839	570 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC2A3	P11169	496 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GLUL	P15104	373 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MRE11	P49959	708 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GAD2	Q05329	585 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM3C	Q92520	227 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TSPAN3	O60637	253 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	LATS1	O95835	1130 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CYP17A1	P05093	508 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ADH5	P11766	374 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CD72	P21854	359 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CTH	P32929	405 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GJA4	P35212	333 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PTPN9	P43378	593 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GALC	P54803	685 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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