RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC12A8A0AV02 714 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PI15O43692 258 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CALB1P05937 261 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DRD1P21728 446 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD72P21854 359 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHKAP35790 457 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAF5Q15542 800 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ASIC2Q16515 512 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXO43Q4G163 708 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FYB2Q5VWT5 728 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRNP1Q6NT89 227 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 C12orf40Q86WS4 652 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ERICH1Q86X53 443 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 C3orf20Q8ND61 904 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD101Q93033 1021 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NPY6RQ99463 290 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 AGPAT1Q99943 283 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SYNCQ9H7C4 482 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXO10Q9UK96 956 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NENFQ9UMX5 172 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A0A0MRY4 1105 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM170BA6NMN3 283 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NCAM2O15394 837 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC2A3P11169 496 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 GZMAP12544 262 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOS2P35228 1153 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FLT3P36888 993 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTPN9P43378 593 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBX4P57082 545 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARID5AQ03989 594 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAD2Q05329 585 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP2R5DQ14738 602 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PON2Q15165 354 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCAF6Q58WW2 860 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 MPP7Q5T2T1 576 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADGRF1Q5T601 910 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM25Q86YD3 366 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DRC7Q8IY82 874 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DEFB106AQ8N104 65 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRSS33Q8NF86 280 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 37.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CAPN9O14815 690 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 AP5Z1O43299 807 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ACSL4O60488 711 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 MFAP3LO75121 409 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TULP3O75386 442 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 ENDOD1O94919 500 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 APOEP02649 317 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 SERPING1P05155 500 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TDGF1P13385 188 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 TYRP14679 529 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXA6P31267 233 aa8.62□□□□□ -1.03
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