RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR23AA6NEV1 266 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 LGALS16A8MUM7 142 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRT4C9JH25 899 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN3O60637 253 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRB5O75023 590 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM23O75077 832 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TULP3O75386 442 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GRAP2O75791 330 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GFPT2O94808 682 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-27P01718 113 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TYRP14679 529 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP11B1P15538 503 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 DRD1P21728 446 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A4P31645 630 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CXCL12P48061 93 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FNTBP49356 437 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GAD2Q05329 585 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NR1H3Q13133 447 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCLQ13371 301 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC32Q14392 662 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ANO4Q32M45 955 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf27AQ580R0 203 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ARTNQ5T4W7 220 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM215Q68D42 235 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TRNP1Q6NT89 227 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 USP33Q8TEY7 942 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 IRGQQ8WZA9 623 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A13Q96H72 371 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 HHIPQ96QV1 700 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PNKPQ96T60 521 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOX2Q99424 681 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 STK33Q9BYT3 514 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NACA2Q9H009 215 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 LHX5Q9H2C1 402 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CBX8Q9HC52 389 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MARK1Q9P0L2 795 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 F8VZ95 297 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SGK1O00141 431 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MED7O43513 233 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 KAT7O95251 611 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GJB6O95452 261 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-25P01717 112 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NCAM1P13591 858 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 WASP42768 502 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ACADSBP45954 432 aa7.31□□□□□ -1.24
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RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN1Q04323 297 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PTK2Q05397 1052 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PTP4A2Q12974 167 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MEA1Q16626 185 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GEN1Q17RS7 908 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB6CQ53S08 254 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TAC4Q86UU9 113 aa7.31□□□□□ -1.24
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