RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 LUZP4Q9P127 313 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EBF1Q9UH73 591 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 POLIQ9UNA4 740 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CLUHO75153 1309 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2C9P11712 490 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF23P17027 643 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP3A7P24462 503 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK4P31152 587 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK8P49336 464 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSEP51690 589 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC13P55735 322 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPCQ03188 943 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GAD2Q05329 585 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SERAC1Q96JX3 654 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 LRGUKQ96M69 825 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP9Q96S59 729 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM22Q9Y584 194 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EMSYQ7Z589 1322 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND3A2RUS2 1198 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ALOX15BO15296 676 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 IL33O95760 270 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL3P08590 195 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FDX1P10109 184 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP3P12645 472 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF12P17014 697 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCY7P51828 1080 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPY1Q01534 308 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ALCAMQ13740 583 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 USP41Q3LFD5 358 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR5Q6UX68 686 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CERS5Q8N5B7 392 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 BORCS5Q969J3 196 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP11Q96EK4 314 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HAUS8Q9BT25 410 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0B4J203 849 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP2A1O14983 1001 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NBNO60934 754 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMPSTE24O75844 475 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT34O76011 436 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINA6P08185 405 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC10A3P09131 477 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRA2P23416 452 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 HMOX2P30519 316 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 COPAP53621 1224 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2A13Q16696 494 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CES4AQ5XG92 561 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KAZNQ674X7 775 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KBTBD6Q86V97 674 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 APOPT1Q96IL0 206 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CGREF1Q99674 301 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 NUF2Q9BZD4 464 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KLC2Q9H0B6 622 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 J3QRK9 145 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MCF2LO15068 1137 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A1P02730 911 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP1A2P05177 515 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 BTDP43251 543 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS19P49795 217 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 CHI3L2Q15782 390 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM151AQ8WW52 585 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL8Q96CD0 374 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms