RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439578.5

SAR1B-202, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAR1B, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1B-202ENST00000439578 E2F8A0AVK6 867 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CCP110O43303 1012 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZSCAN12O43309 604 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 KRT86O43790 486 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 LCA5LO95447 670 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PRAMEF12O95522 483 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 NFATC1O95644 943 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 LATS1O95835 1130 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TBX18O95935 607 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CYP1A2P05177 515 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TCF3P15923 654 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CHKAP35790 457 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 VIPR2P41587 438 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PTPN9P43378 593 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ATP11AP98196 1134 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZP2Q05996 745 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RING1Q06587 406 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PTP4A2Q12974 167 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MAMLD1Q13495 774 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TDGQ13569 410 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ACAP1Q15027 740 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PDGFRLQ15198 375 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PARM1Q6UWI2 310 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 STRADAQ7RTN6 431 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 EMC1Q8N766 993 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RFFLQ8WZ73 363 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 OTUB2Q96DC9 234 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CNPY3Q9BT09 278 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RNF38Q9H0F5 515 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 WDCPQ9H6R7 721 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 KCNK12Q9HB15 430 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.13□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 OBSL1O75147 1896 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CHADO15335 359 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 IRAK2O43187 625 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PRPSAP2O60256 369 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ADH1CP00326 375 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GDI1P31150 447 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FLT3P36888 993 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 VAV2P52735 878 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 AIF1P55008 147 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 USP4Q13107 963 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 HTR4Q13639 388 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GRM2Q14416 872 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PPP2R5DQ14738 602 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF77Q15935 545 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SYPL2Q5VXT5 272 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 LRRC31Q6UY01 552 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GJD3Q8N144 294 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CPA6Q8N4T0 437 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 FGF14Q92915 247 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 BTN2A3PQ96KV6 586 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SLC22A12Q96S37 553 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TBCBQ99426 244 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GKN1Q9NS71 199 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CCL26Q9Y258 94 aa11.12□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ANHXE9PGG2 379 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 STC2O76061 302 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 GJB6O95452 261 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 BMP1P13497 986 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 ARHGAP25P42331 645 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PGFP49763 221 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 CCDC14Q49A88 953 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 EFHC2Q5JST6 749 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.11□□□□□ -0.63
SAR1B-202ENST00000439578 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms