RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ISOC1Q96CN7 298 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PPME1Q9Y570 386 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ABCC6O95255 1503 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TPST1O60507 370 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 COX4I1P13073 169 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TGM2P21980 687 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AMPD1P23109 780 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL35Q6PF15 583 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3R3Q92569 461 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AP3S1Q92572 193 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CEP170P1Q96L14 293 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 C1orf21Q9H246 121 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PTGES3LE9PB15 166 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC22A1O15245 554 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IL32P24001 234 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 VMP1Q96GC9 406 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SCN4AP35499 1836 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB5O15062 677 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RARBP10826 455 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PICALMQ13492 652 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NUMA1Q14980 2115 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TRABD2AQ86V40 505 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MCFD2Q8NI22 146 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RBBP8Q99708 897 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MYPNQ86TC9 1320 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ABL1P00519 1130 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CD320Q9NPF0 282 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SNX7Q9UNH6 387 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FUOMA2VDF0 154 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ECE2O60344 883 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 OR7A10O76100 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NME5P56597 212 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TCF12Q99081 682 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NAT9Q9BTE0 207 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LGR6Q9HBX8 967 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RCCD1A6NED2 376 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 E7ENX8 843 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SNAPC5O75971 98 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRDX6P30041 224 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KLRC3Q07444 240 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IFNA7P01567 189 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GCLMP48507 274 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IL5RAQ01344 420 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POU5F1BQ06416 359 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LAYNQ6UX15 382 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PALB2Q86YC2 1186 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC19Q9H756 370 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.62□□□□□ -1.35
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