RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 PREBQ9HCU5 417 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 SERPINB4P48594 390 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 NOTUMQ6P988 496 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 MAF1Q9H063 256 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.54■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 I3L4J1 428 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 GPR32O75388 356 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 NUMBP49757 651 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CCNYQ8ND76 341 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 TTC8Q8TAM2 541 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 LPPQ93052 612 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 KPNA7A9QM74 516 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 LPXNO60711 386 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ETS2P15036 469 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 MROH9Q5TGP6 573 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 TLK2Q86UE8 772 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 TEX9Q8N6V9 391 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CCDC78A2IDD5 438 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 TYROBPO43914 113 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 GTF2A2P52657 109 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 NME8Q8N427 588 aa21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 KITP10721 976 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 RCN2Q14257 317 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 AGAP3Q96P47 875 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 MED10Q9BTT4 135 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CYB561D2O14569 222 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 BGNP21810 368 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 FOXB2Q5VYV0 432 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 DEFB106AQ8N104 65 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 HASPINQ8TF76 798 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 CHKBQ9Y259 395 aa21.52■■□□□ 1.04
SPRN-201ENST00000414069 ENTPD5O75356 428 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 RASIP1Q5U651 963 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 CYTH2Q99418 400 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 GALNT8Q9NY28 637 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 USP12O75317 370 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 AP1B1Q10567 949 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 TAZQ16635 292 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 DBN1Q16643 649 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 PIGZQ86VD9 579 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 SNX17Q15036 470 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 BOLA3Q53S33 107 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 WSCD1Q658N2 575 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 OSTM1Q86WC4 334 aa21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 GM2AP17900 193 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 SULT1E1P49888 294 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 MAP3K7CLP57077 242 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 KCNJ11Q14654 390 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 APPL2Q8NEU8 664 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 ASB3Q9Y575 518 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 KCNK1O00180 336 aa21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 STIP1P31948 543 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SPRN-201ENST00000414069 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms