RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM173BQ6P4H8 233 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPD1LQ8N335 351 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 EID2Q8N6I1 236 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM184AQ8NB25 1140 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RDH13Q8NBN7 331 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SAP25Q8TEE9 199 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSC1Q92574 1164 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGSF8Q969P0 613 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 HVCN1Q96D96 273 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACCSQ96QU6 501 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MED10Q9BTT4 135 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX25Q9H3E2 840 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLMPQ9H6B4 373 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLIC4Q9Y696 253 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 AK5Q9Y6K8 562 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PR77 199 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM47DPA6NHR8 397 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GFRA2O00451 464 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLIC2O15247 247 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGFB1I1O43294 461 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDC3O75056 442 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEMA4FO95754 770 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNNC2P02585 160 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPOP05164 745 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RARGP13631 454 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 IDEP14735 1019 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 JUPP14923 745 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADORA2BP29275 332 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 HLA-FP30511 346 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBA7P41226 1012 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRIA4P48058 902 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP3CCP48454 512 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP2CBP62714 309 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP2CAP67775 309 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP24A1Q07973 514 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 EHHADHQ08426 723 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 STARD3Q14849 445 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 POSTNQ15063 836 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDE2Q6IQ49 451 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DPH6Q7L8W6 267 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR49Q8IV35 697 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR2T3Q8NH03 318 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC127Q96BQ5 260 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CALML4Q96GE6 196 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYO19Q96H55 970 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CGRRF1Q99675 332 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARID3AQ99856 593 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP58Q9BVL2 599 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PANK2Q9BZ23 570 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CIPCQ9C0C6 399 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 LHX5Q9H2C1 402 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM245Q9H330 911 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYLDQ9NQC7 956 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms